В 1842 году на месте нынешней школы были построены царские конюшни.
С 1926 года на месте царских конюшен была основана начальная школа.
С 1937 года начальная школа была преобразована в Балтинскую семилетнюю школу Северо - Осетинской АССР Пригородного района.
С 1937 года до декабря 1959 года она являлась семилетней школой. В 1942 году директором школы был Митюшкин Николай Васильевич.
С 15 августа 1947 года директором школы назначают Тамаеву Хаву Магометовну. В 1950 году – Санакоев А. Ф.
С 3 декабря 1955 года по 1966 год директором школы был Кораев Дмитрий Тимофеевич.
С 1959 года по 1963 год школа являлась восьмилетней.
В 1964 году преобразована в десятилетнюю школу.
В 1966 году школа стала Средней общеобразовательной школой с. Балта. В этом же году еѐ директором стал Шавлохов К.А.
С 1970 по 1978 год директор школы - Цопанов Борис Харитонович.
С 10 января 1978 года директором школы становится Плиев Яков Сергеевич.
В 1982 году директором опять назначается Цопанов Борис Харитонович, который проработал до 1999 года.
С 7 ноября 1999 года по август 2009 года директором Балтинской СОШ являлась Бутхузи Нателла Николаевна.
С сентября 2009 года по сентябрь 2010 года временно исполняющим директором школы был Пухаев Владимир Николаевич.
С сентября 2010 года и по нынешнее время директором МБОУ СОШ с. Балта является Бучукури Инга Отариевна.